Karamihan sa mga STR ay matatagpuan sa mga noncoding na rehiyon, habang humigit-kumulang 8% lang ang matatagpuan sa mga coding region (3). Bukod dito, ang kanilang mga densidad ay bahagyang nag-iiba sa mga chromosome. Sa mga tao, ang chromosome 19 ay may pinakamataas na density ng mga STR (4). Sa karaniwan, isang STR ang nangyayari sa bawat 2, 000 bp sa genome ng tao (5).
Saan ako makakahanap ng short tandem repeats?
DNA SeparationsKasunod ng PCR amplification, ang kabuuang haba ng STR amplicon ay sinusukat upang matukoy ang bilang ng mga pag-uulit na makikita sa bawat allele na makikita sa DNA profile. Ginagawa ang pagsukat ng haba na ito sa pamamagitan ng isang nakabatay sa sukat na paghihiwalay na kinasasangkutan ng gel o capillary electrophoresis (CE).
Saan matatagpuan ang mga pag-uulit ng tandem?
Ang mga pag-uulit ng tandem ay nagaganap sa DNA kapag ang isang pattern ng isa o higit pang mga nucleotide ay inuulit at ang mga pag-uulit ay direktang magkatabi. Ang ilang mga domain ng protina ay bumubuo rin ng magkasunod na pag-uulit sa loob ng kanilang pangunahing istraktura ng amino acid, gaya ng pag-uulit ng armadillo.
Ilang short tandem repeats ang mayroon?
Noong 1997, hinirang ng Federal Bureau of Investigation (FBI) ang 13 autosomal STR loci upang mabuo ang core ng Combined DNA Index System (CODIS), isang database na binubuo ng mga profile iniambag ng federal, state, at lokal na forensic laboratories.
May parehong short tandem repeats ba ang lahat?
Ang pagsisiyasat sa mga noncoding na rehiyon na ito ay nagpapakita ng mga paulit-ulit na unit ng DNA na nag-iiba-iba ang haba sa mga indibidwal. Natuklasan ng mga siyentipiko na ang isang partikular na uri ng pag-uulit, na kilala bilang short tandem repeat (STR), ay medyo madaling sinusukat at inihambing sa pagitan ng iba't ibang indibidwal
