Ang
BigWig ay isang format ng file para sa pagpapakita ng siksik, tuluy-tuloy na data sa isang genome browser track, na ginawa sa pamamagitan ng conversion mula sa Wiggle (WIG) na format. Ang format ng BigWig ay inilalarawan sa web site ng UCSC Genome Bioinformatics, at ang gabay sa format ng file ng Broad Institute ay nagbibigay ng karagdagang impormasyon.
Ano ang bigWig format?
Ang format ng bigWig ay para sa pagpapakita ng siksik, tuluy-tuloy na data na ipapakita bilang isang graph BigWig file ay unang ginawa mula sa WIG type na mga file, gamit ang UCSC program wigToBigWig. Bilang kahalili, ang mga bigWig file ay maaaring gawin mula sa bedGraph file, gamit ang UCSC program na bedGraphToBigWig.
Paano ko gagamitin ang bigWig file?
Ilipat ang bagong likhang bigWig file (myBigWig.bw) sa isang naa-access sa web na http, https, o lokasyon ng ftp. I-paste ang URL sa custom na track entry form o bumuo ng custom na track gamit ang isang linya ng track. I-paste ang custom na linya ng track sa text box sa page ng custom na pamamahala ng track.
Ano ang bigWig track?
Ang
bigWig Tracks ay track para sa tuluy-tuloy na signal sa buong genome. Angkop ang mga ito para sa pagpapakita ng iba't ibang "raw" na resulta ng eksperimento gaya ng mga ChIP-Seq signal, RNA-Seq signal, atbp.
Paano ako gagawa ng bigWig file?
Mayroong maraming paraan upang makabuo ng mga bigwig file. Ito ay karaniwang nagsasangkot ng pag-convert ng isang. bam file sa isang wiggle track (. wig) at pagkatapos ay i-convert ang wiggle track sa isang binary bigwig (.
