Nakukuha ng pagmomodelo ng homology ang ang tatlong dimensional na istraktura ng isang target na protina batay sa pagkakapareho sa pagitan ng template at mga target na pagkakasunud-sunod at ang diskarteng ito ay nagpapatunay na mahusay pagdating sa pag-aaral ng mga protina ng lamad na mahirap i-kristal tulad ng GPCR dahil nagbibigay ito ng mas mataas na antas ng pag-unawa sa …
Ano ang homology modeling at bakit ito kailangan?
1.2.
Ang pagmomodelo ng homology ay ang pinakatumpak na paraan ng computational upang lumikha ng mga maaasahang modelong istruktura at karaniwang ginagamit sa maraming biological application. Ang pagmomodelo ng homology ay hinuhulaan ang 3D na istraktura ng isang query na protina sa pamamagitan ng pagkakahanay ng pagkakasunud-sunod ng mga protina ng template.
Ano ang prinsipyo ng homology Modelling?
Ang
Homology modeling ay kilala rin bilang comparative modeling na hinuhulaan ang mga istruktura ng protina batay sa sequence homology na may mga kilalang istruktura. Nakabatay ito sa prinsipyo na “ kung ang dalawang protina ay may sapat na mataas na pagkakapareho ng pagkakasunud-sunod, malamang na magkapareho ang mga ito ng three-dimensional na istruktura.”
Ano ang gumagawa ng magandang homology Modelling?
Kung tutukuyin natin ang isang "highly successful homology model" bilang isang may <=2 Å rmsd mula sa empirical structure, kung gayon ang template ay dapat may >=60% sequence identity na may target para sa isang tagumpay rate >70% Kahit sa mataas na pagkakasunud-sunod na pagkakakilanlan (60%-95%), kasing dami ng isa sa sampung homology na modelo ang may rmsd >5 Å vs.
Alin sa mga sumusunod ang totoo tungkol sa Pagmomodelo ng homology?
Paliwanag: Gaya ng ipinahihiwatig ng pangalan, ang pagmomodelo ng homology naghuhula ng mga istruktura ng protina batay sa sequence homology na may mga kilalang istruktura Ang pagmomodelo ng homology ay gumagawa ng all-atom na modelo batay sa pagkakahanay sa mga template ng protina.… Ang mga error na ginawa sa hakbang sa pag-align ay hindi maaaring itama sa mga sumusunod na hakbang sa pagmomodelo.
