Ang pagkawala ng conformational entropy ay isang malaking kontribusyon sa thermodynamics ng protein folding Gayunpaman, napatunayang mahirap ang tumpak na pagtukoy ng dami. Kinakalkula namin ang pagkawalang ito gamit ang molecular dynamic simulation ng parehong native na protina at isang makatotohanang denatured state ensemble.
Ano ang conformational entropy protein?
Ang
Conformational entropy ay ang entropy na nauugnay sa bilang ng mga conformation ng isang molecule. … Sa mga protina, ang backbone dihedral angle at side chain rotamer ay karaniwang ginagamit bilang mga parameter, at sa RNA ang base pairing pattern ay maaaring gamitin.
Alin ang may mas malaking conformational entropy isang nakatiklop na protina o nakabukas na protina?
Ang conformational entropy ng polypeptide chain ay mas malaki para sa unfolded state kumpara sa mas compact na folded state na nailalarawan ng mas pinaghihigpitang conformational space. Samakatuwid, pinatatatag ng kontribusyong ito ang hindi nabuksang estado (ΔSconf > 0).
Ano ang tumutukoy sa pagbuo ng protina at ano ang problemang nauugnay sa pagtitiklop ng protina?
Ang pangunahing istraktura ng isang protina, ang linear amino-acid sequence nito, ay tumutukoy sa native conformation nito. Ang mga tiyak na residue ng amino acid at ang kanilang posisyon sa polypeptide chain ay ang pagtukoy sa mga salik kung saan ang mga bahagi ng protina ay tumiklop nang malapit sa isa't isa at bumubuo ng three-dimensional conformation nito.
Anong mga salik ang nakakaapekto sa pagtitiklop ng isang protina?
Ang pag-fold ng protina ay isang napakasensitibong proseso na naiimpluwensyahan ng ilang panlabas na salik kabilang ang electric at magnetic field, temperatura, pH, mga kemikal, limitasyon sa espasyo at molecular crowdingAng mga salik na ito ay nakakaimpluwensya sa kakayahan ng Mga Protein na matiklop sa kanilang mga tamang functional form.
